注册公司在杭州和上海都有各自的优势，具体选择哪个城市要根据您的需求和实际情况来决定。
1、杭州是一座充满活力和创新精神的城市，创业氛围浓厚，政府支持创业，提供了很多优惠政策和扶持措施。
2、杭州的互联网产业非常发达，如果您的公司与互联网、电子商务、信息技术等相关，杭州是一个非常好的选择。
3、杭州的生活成本相对较低，包括房价、人力成本等，这对于初创公司来说是一个重要的考虑因素。
在上海注册公司的好处包括：
1、上海是中国最大的经济中心之一，拥有完善的产业链和丰富的资源，对于各种行业都有很好的发展前景。
2、上海的金融、贸易、服务业等行业非常发达，如果您的公司与这些行业相关，上海是一个更好的选择。
3、上海的市场更加国际化，对于想要拓展国际市场或与国际企业合作的公司来说，上海是一个非常重要的门户城市。
如果您更看重互联网产业和初创公司的氛围，同时希望生活成本较低，那么杭州可能是更好的选择；如果您更看重金融、贸易、服务业等行业的发展前景，同时希望公司能够拓展国际市场，那么上海可能是更好的选择，不过最终的决定还需要根据您的具体情况和需求来做出。
