注册一百万的公司需要缴纳的费用包括注册资本、印花税和工本费。具体来说，注册资本不需要缴纳额外的费用，只需按照公司章程规定的金额在规定时间内完成实缴即可。印花税按照注册资本的万分之五计算，一百万的公司需要缴纳印花税为五千元。此外，还需要支付一些工本费，包括工商注册费、代理费和其他费用等。这些费用因地区和行业而异，具体金额可以咨询当地工商局或代理机构。因此，除了注册资本外，注册一百万的公司大致需要缴纳几千元的额外费用。
仅供参考，建议咨询所在地相关机构获取具体费用信息，同时请注意，公司注册后还有后续的运营成本需要考虑。
