农村自建房子注册公司赔偿的问题，需要根据具体情况进行分析。一般来说，赔偿涉及的因素包括房屋的价值、用途、所在地区等。
如果自建房是合法建筑，且相关手续齐全，那么可以根据房屋的实际价值和用途来获得相应的赔偿，如果房屋是用于注册公司的经营场所，还需要考虑停产停业损失等补偿。
具体的赔偿标准可能因地区和政策而异，不同地区可能有不同的土地征收和房屋拆迁政策，因此赔偿金额也会有所不同，建议您咨询当地相关部门了解具体的赔偿政策和标准。
如果自建房存在违法建筑等问题，可能会影响赔偿金额，在自建房之前，最好先了解当地的建筑规定和法律法规，确保自建房的合法性。
农村自建房子注册公司赔偿的问题需要根据具体情况进行评估和确定，建议您在面临此类问题时，及时咨询当地相关部门或律师，以获得准确的指导和帮助。
