注册会计师在被审计单位期末存货盘点时不在现场可能会带来一些问题和风险。这种情况下，注册会计师需要采取一些额外的措施来确保审计的质量和准确性。
注册会计师需要了解为何未能亲自参与盘点，如果是由于特殊情况，如突发事件、健康问题或其他不可抗因素导致无法亲自到场，那么注册会计师应该与被审计单位进行沟通，了解存货管理的情况和内部控制的有效性，注册会计师还需要评估未能亲自参与盘点可能对审计结果产生的影响。
注册会计师可以利用替代程序来弥补未能亲自参与盘点的缺陷，可以要求被审计单位提供存货明细表、库存数量变动记录、相关凭证和照片等证明材料，通过这些材料，注册会计师可以了解存货的数量、种类和存放状态等信息，注册会计师还可以利用第三方物流或仓储公司的数据来验证被审计单位的存货信息。
注册会计师还需要关注被审计单位的内部控制情况，如果内部控制存在缺陷或存在舞弊风险，那么未能亲自参与盘点可能会给审计带来更大的风险，注册会计师需要对内部控制进行充分了解和评估，并采取相应的措施来降低风险。
注册会计师需要在审计报告中充分说明未能亲自参与盘点的情况以及采取的替代程序，注册会计师还需要在报告中提及可能存在的风险和不确定性因素，以便报告使用者能够充分了解审计结果的可信度和可靠性。
虽然注册会计师未能亲自参与被审计单位期末存货盘点会带来一定风险，但通过采取适当的措施和替代程序，仍然可以确保审计的质量和准确性。
