如果公司注册地址和实际经营地址不一样，可能会给起诉带来一些挑战，但并非不能起诉。以下是针对这种情况可以采取的起诉步骤。
1、查明实际经营地址：首先需要查明公司实际的经营地址，可以通过公司网站、电话联系、邮件联系等方式进行确认。
2、获取证据：在起诉之前，需要收集相关证据，证明该公司注册地址与实际经营地址不一致，并且你在其实际经营地址上与其发生了纠纷，证据可以包括合同、发票、送货单、邮件、短信、电话录音等。
3、确定管辖法院：根据民事诉讼法的规定，起诉应当向有管辖权的法院提出，对于合同纠纷，可以向合同实际履行地（即实际经营地址所在地）的法院提起诉讼，如果无法确定实际经营地址，可以向公司注册地址所在地的法院提起诉讼。
4、提交起诉材料：准备好起诉状和其他相关证据材料，向法院提交起诉材料，在起诉状中应当明确说明双方当事人的情况、纠纷的事实和证据、诉讼请求等。
5、等待法院处理：法院在收到起诉材料后，会进行审查并决定是否受理，如果受理，将会通知被告并安排开庭审理。
需要注意的是，如果公司注册地址与实际经营地址不一致，可能会影响法院的送达和管辖，在起诉之前需要充分了解相关法律规定，并在律师的指导下进行操作。
仅供参考，建议在咨询律师后进行操作，以便更好地维护自身权益。
