公众号的注册费用与小程序是分开计算的。注册公众号时，需要缴纳每年200元的认证费用，无论小程序的数量多少，认证费用都是固定的。至于注册小程序的具体费用，取决于小程序的类型和功能需求。普通小程序注册是免费的，高级版本的商城小程序或特殊功能的小程序会有额外的开发费用及功能费用，具体金额需要咨询开发团队或相关服务商。因此，公众号注册小程序本身的费用取决于具体情况。
信息仅供参考，建议咨询微信客服获取准确信息，另外也要注意，除了注册费用，还要考虑到后续运营公众号和小程序的其他成本，如服务器成本、维护成本等。
